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Drosofly

8 novembre 2012

Présentation du projet DROSOFLY... et de moi même!^^

Présentation du projet DROSOFLY... et de moi même!^^
Bonjour à tous, Dans ce blog, vous découvrirez la génétique de la drosophile (Drosophila melanogaster), comment faire des croisements de cet organisme modèle (Back Cross, Crossing Over...) observation de chromosomes, observation et découverte des mutations...
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29 novembre 2012

Gros plan: la souche Yellow White

Le repiquage de cette souche s'imposait. J'en ai profité pour faire une petite "séance photo" pour que l'on puisse faire connaissance avec cette souche alliant    2 mutations différentes qui sont : White et Yellow


La première, je vous en ai déjà parlé, mais je vais néanmoins faire un petit récap': cette mutation est localisée sur le chromosome 1 ce qui en fait une mutation liée au sexe (à prendre en compte lors des croisements). Les yeux de la drosophile sont d'un blanc pur. C'est à peu près tout... Si vous souhaitez plus d'info regardez quelques articles plus bas! ;)

Maintenant, passons à la mutation Yellow: pour changer elle aussi est liée au sexe. Toutes les zones du corps ne sont pas toutes jaunes miel. Certaines tirent plus vers le type sauvage mélangé au jaune miel ce qui fait que la couleur n'est pas uniforme sur toute la mouche. Je n'ai pas beaucoup d'informations à propos de cette mutation mais je tacherai de me renseigner encore davantage.

Deux mutations liées au sexe...Hmm il va falloir tester cela en croisement!^^

Maintenant, je vais vous présenter deux photos de drosophiles Yellow White [YeW] provenant de mon labo:

les photos ont été prises par moi même excusez-moi pour la médiocre qualité étant donné que je les réalise avec mon APN...

DSC01845

Voici une femelle. Vous notterez l'absence de tache noire caractérisque. Elle est typique de la souche: corps "jaune miel" et oeil blanc

DSC01846

Et voici le mâle avec sa tache noire caractéristique (que l'on ne voit pas bien bouhou...) !

Surtout n'hésitez pas à me faire part de vos commentaires/suggestions cela aidera à faire progresser le blog! :)

 

Jules

 

 

 

24 novembre 2012

Enfin!

Enfin! ça y est! J'ai une partie de mon labo qui fonctionne!!! C'est génial! Un rêve qui se réalise! J'ai reçu ma commande sordalab ainsi que mes différentes souches. Photos à l'appui!

DSC01814

                                    DSC01815

Ce que vous voyez à l'écran c'est la partie Observation;Croisement;Déduction la seule à être activé pour le moment                                                                            DSC01827

 La loupe binoculaire!!! Indispensable!

 

DSC01828

 

 

 

 

L'éthériseur... L'appareil servant à endromir les drosophiles! Je sens qu'il va servir!

 

 

 

 

 DSC01830              DSC01829

                           Le FLYNAP                                                        et son packaging! 

qui est le produit servant à endormir les drosophiles

 

                                                               DSC01831

                                                                       Le Milieu Instantané pour Drosophile


C'est tout mon matériel pour l'instant. Il me manque encore une blouse, un microscope... et plein d'autres choses!

Passons maintenant aux différentes souches:

 

DSC01816


Dans l'ordre de gauche à droite:

souche Yellow White la mouche possède des yeux blancs et un corps jaune.

souche Dumpy drosophile possédant des ailes mutées "découpées" d'une certaine façon (nous y reviendrons!)

souche Apterous Sepia qui se caractérise par une absence totale d'ailes et des yeux bruns foncés

souche Vestigiale Yellow White qui est la même que la souche Yellow White mis à part que cette souche possède des ailes réduites à 

des vestiges (voir description plus bas)

souche Vestigiale dont les ailes sont froissées et réduites à des vestiges (voir description plus bas)

souche Sauvage oeil rouge brique, aile normale... la drosophile sauvage type.Indispensable pour les coisements!

souche White qui ne diffère de la souche sauvage que par des yeux d'un blanc pur.

et enfin la souche Vestigiale Ebony: ailes vestigiales et corps brun.

 

Le reste ça sera pour noel!

 

 

                               

 

15 novembre 2012

Un oeil de drosophile bicolore: c'est possible???

Bonsoir!

Aujourd'hui, j'ai eu ma première idée de croisement original: croiser une souche Sauvage (yeux rouges) et une souche White (yeux blancs) le but de ce croisement étant de pouvoir (peut-être) créer une souche de drosophile possédant un oeil bicolore (je sais que cela a déjà été réalisé). C'est à dire une souche dont les parents auront des yeux mi blanc mi rouge et dont TOUTE la F1 aura des yeux mi rouge mi blanc.

A quand la drosophile oeil bleu blanc rouge?^^

Plus sérieusement: qu'en pensez-vous?

Jules

 

13 novembre 2012

La souche Vestigiale et la souche White

Bonjour!

Aujourd'hui je vais vous parler de la génétique des souches de drosophiles Vestigiales et White

La souche Sauvage [+]

La souche sauvage se caractérise par un corps marron clair/ miel, des yeux rouges briques, une paire d'aile, des yeux ronds et un corps normal: la drosophile type

La souche Vestigiale [Vg]

 

148_thumb

 

Cette souche est la même que la souche sauvage à part qu'elle possède des ailes chiffonées dû à l'absence de proteines rigidifiant les ailes. Les ailes sont donc entières mais chifonnées, les nervures sont toujours visibles. Les mouches sont incapables de voler. Cette mutation est localisée sur le chromosome 2. Elle n'est donc pas liée au sexe. Lors d'un croisement Sauvage/White les ailes n'ont pas tout à fait le phénotype sauvage: elles sont très légèrement "dentées".  Cette mutation est d'origine spontanée.

La souche White [W]

 

155_thumb

 


La drosophile possède des yeux d'un blanc pur de part l'absence de pigments colorant l'oeil. Elle est portée sur le chromosome 1 ce qui en fait une mutation liée au sexe (voir pour les croisements). Cette muation est d'origine spontanée. 

 

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12 novembre 2012

Productivité d'une souche de drosophile sur différents milieux par rapport à d'autres souches.

Bonjour à toutes/tous,

Voici la première expérience de la section Microscopie,Experimentation... et certainement la première manipulation avec raisonnement scientifique du projet DROSOFLY:

Pour cette  expérience nous allons choisir 3 souches portant sur des caractères différents:

-la souche Sauvage [+]: elle présente des ailes normales, oeil rouge brique.

-la souche Vestigiale [Vg]: les ailes sont "chiffonées" 

-la souche White [W] qui possède un oeil blanc.

  Productivité d'une souche sur différents milieux.

Pour cette partie de l'experience, nous allons cultiver ces 3 souches sur 6 milieux différents (ce qui fera un total de 18 tubes pour cette partie de l'expérience)

Voici la liste des 5 milieux différents:

- milieu déshydraté Carolina 4-24: un milieu avec antifongique et antioxidant contenant toutes les substances nécessaires à une croissance optimale de la drosophile (Composition inconnue)

- milieu de laboratoire standard à fait ses preuves chez dans de nombreux labo! ( 100g de farine/semoule de mais, 80g de levure de bière fraiche (20g pour l'extrait), 16g d'agar-agar, 40 mililitres de Nipagine (syn. Moldex) et 1 Litre d'eau déminéralisée

- milieu maison riche 1 : 40% de compote de pomme (bon marché), 35% de farine de mais (bon marché toujours), 10% de sirop de glucose du vinaigre et un petit peu d'eau pour retrouver la consistance de votre compote de pomme. 10 minutes à feux doux 

-milieu maison riche 2: 30% de banane bien mûre;20% de vinaigre; 20% de pdt déshydratée, 20% de semoule de mais (maizena) et 10% de lait. ajouter assez de vinaigre et d'eau pour avoir la consistance d'une compote de pomme industrielle. 10 minutes à feu doux

- milieu maison pauvre 1: 70% de semoule de mais; 20% de vinaigre; 10% de sirop de glucose. ajouter de l'eau pour obtenir la consistance d'une compote de pomme.    

- milieu maison pauvre 2: 50% de semoule de mais; 45% de vinaigre; 5% de lait. Toujours la même consistance que les milieux précedents.

Pour la préparation de mes tubes de culture, je verse environ 2cm de milieu. Pour augmenter la production des souches, je dispose un support dans mes tubes de cultures, un bout de carton peut faire l'affaire sur le court terme mais la moustiquaire c'est top!

Protocole:

 

Dans chaque tube, j'introduis 20 drosophiles femelles pour 12 drosophiles mâles qui est la ratio optimale (moyenne de plusieurs sites) manipuler sous la loupe binoculaire. Je laisse les mouches se reproduire. Dès que j'observe des pupes sur les parois, je retire les parents des tubes de culture pour éviter le mélange des génération. Une fois que les premiers imagos sont sortis attendre 3 jours qu'ils naissent tous. Compter sous la loupe binoculaire le nombre de mâles et de femelles puis établir un total. Je compare les résultats avec ceux des autres milieux . Je fais une liste des milieux du plus performant au moins performant suivant les souches et individuelement pour chaque souche.

Je pense que je vais commencer les milieux fin de semaine et que l'expérience commencera la semaine prochaine suivant la croissance de mes souches et suivant la date d'arrivée de la commande.

But de l'expérience


Le but de l'expérience est de savoir si une souche de drosophile est plus compétitive que l'autre, si la souche sauvage est la plus prolifique (donc la plus plastique quant aux habitats naturels?) et si les mutations White et/ou Vestigiales sont elles plus productives ou moins productives par rapport à la souche sauvage? Est-ce du à la mutation?

 

 

 

 

 

10 novembre 2012

Les 2 sections du projet et newsletters

Comme vous l'avez peut-être déjà remarqué, le blog présente 2 catégories principales:

-Observation; croisement;déduction

- Microscopie; expérimentation

Dans la première partie vous pourrez trouver tous les renseignements concernant:

-l'observation des drosophiles (sous la loupe binoculaire essentielement); comment les manipuler; différence mâle/femelle; différents phénotypes...

- les croisements de drosophiles; comment les réaliser?; comment réaliser un tableau de croisement?; récessivité/dominance; Back-Cross etc.

- la déduction: comment interpréter les résulats d'un croisement; les mutations chez les drosophiles?

Dans la seconde partie on trouvera:

-Des techniques de microscopies (par ex. observation de chromosomes géants; oeil de drosophile)

- DES EXPERIENCES!!!!! tester la productivité d'une souche sur un milieu de culture donné; une souche est-elle plus productive qu'une autre sur un même milieu; comment la drosophile va-t-elle réagir si je la cultive dans le noir, à 11° va-t-elle muter?

Et ce ne sont que des exemples! J'en ai plein d'autres en tête!

LES NEWSLETTERS...

Depuis ce matin,  11h34, vous pouvez vous abonner à une newsletter bimensuelle gratuite dont la première sera publiée le 15 novembre. Elle résumera brièvement les nouveaux articles, les nouvelles experiences et mes nouvelles idées (plus ou moins farfelues)

Pour vous abonner, c'est très simple il suffit d'aller à la fin du menu à gauche juste en dessous des flux RSS, vous entrez votre adresse mail et vous cliquez sur "M'abonner" et voilà! c'est fait! vous recevrez une newsletter toutes les quinzaines du mois.

ABONNEZ-VOUS! 

 

 

9 novembre 2012

La biologie de synthèse: Introduction

Bonjour!

Vous connaissez la biologie de synthèse? C'est cette branche de la biologie qui permet de "fabriquer" a partir de "rien" un être vivant. C'est toutnouveau, on commence à en parler depuis début 2000 avec Craig Venter et ça excite les biologistes du monde entier mais cela leur fait aussi peur!

  

220px-Craigventer2

 Craig Venter, considéré comme un des fondateurs sinon LE fondateur de la biologie de synthèse

Pourquoi la biologie de synthèse les intéresse-t-ils?  

La biologie de synthèse peut ouvrir des portes vers la conception de biocarburant à l'aide d'algues de synthèse ce qui permetrait de supprimer totalement ou du moins partielement les conflits entre les champs de production du bio carburant (colza; maïs;betterave) et des autres champs destinés à la production de denrées alimentaires. De plus la biologie de synthèse peut être aussi utile dans d'autres domaines comme la santé.

téléchargement

champ de colza, plante très utilisée pour la production de biocarburants

Pouquoi la biologie de synthèse fait-elle peur?                        

La biologie de synthèse peut faire peur du fait qu'elle puisse être mal maitrisée, que les organismes de synthèse puissent contaminer l'environnement et/ou l'être humain, ou encore qu'elle soit utilisée à des fins criminelles (par exemple attentat biologique).

Craig Venter et Mycoplasma laboratorium

Craig Venter et son équipe d'une vaingtaine de chercheurs a reussi en 2007 à créer une un chromosome totalement synthétique ( le JCVI-syn1.0)  que la brillante équipe a implanté à l'intérieur de la membrane plasmique (enveloppe) de la bactérie Mycoplasma genitalium.

 venter_bacterie                                                            synthetic_bio_full


2 colonies de Mycoplasma laboratorium                                        Colonies de M. laboratorium comparées à l'extrémité d'une pipette

 Aussi, Mr. Venter à fait une demande de brevet pour cette bactérie de synthèse, ce qui pose une question de bioéthique évidente : 

A-t-on le droit de s'approprier ainsi le vivant en brevetant ces découvertes? Ce n'est pas la première dois que Craig Venter agit ainsi: il a déjà déposé des brevets sur  25 000 EST (etiquettes de séquence exprimées) associés à des gènes exprimés dans le cerveau humain ce qui provoque un énorme débat dans la comunauté scientifique.

Revenons aux caractéristiques du génome de synthèse de Mycoplasma laboratorium: celui-ci est composé de 1 077 947 paires de bases formant un génome circulaire totalement de synthèse. Mais si le génome l'est, le cytoplasme ne l'est pas car il est intégralement issu de la bactérie Mycoplasma genitalium.

Un organisme semi-synthétique donc? 

 

 

 

8 novembre 2012

C'est parti!

Bonsoir!

Je vous informe que mon projet devrais concrètement démarrer courant semaine prochaine car la commande du matériel et de différentes souches devrai arriver vers jeudi prochain (le 15 novembre). Elle comporte:

-Une loupe binoculaire grossissement x 20 (pour pouvoir observer, trier, déterminer les sexes des drosophiles)

- Un éthériseur (appareil servant à endormir les drosophiles afin d'éviter qu'elles ne s'échappent en s'envollant ou en courant (pour les souches non aptes au vol)

- Flynap (produit placé dans l'éthériseur servant à endomir les drosophiles qui a la même fonction que l'ether)

- 70 tubes + bouchons en mousse ( récipients de culture pour les drosophiles)

- milieu en poudre déshydraté (milieu nutritif pour drosophile, très pratique!)

-Souche Dumpy [Dp] (souche de drosophile aux ailes découpées d'une certaine façon)

- Souche Sauvage [+] (il s'agit de la Drosophila melanogaster) sauvage que l'on peut trouver chez nous)

- Souche Vestigial [Vg] ( cette souche se caractérise par des ailes froissées et petites dû à l'absence de protéines rigidifiantes)

- Souche White [W] (la drosophile possède des yeux blancs à cause de l'absence de pigments colorant l'oeil)

- Souche Vestigiale-Ebony [VgEb] (la drosophile à les ailes vestigiales et le corps marron/brun)

-Souche Yellow-White [YeW] ( cette souche a des yeux blancs et un corps jaune )

Souche Apterous-Sepia [ApSe] (absence totale d'ailes et oeil brun)

 

Tout ceci va me permettre de rélaliser beaucoup de croisements et de faire beaucoup d'observations sous la loupe bino! Je sens que je vais m'amuser!

Je vous expliquerais les caractéristqiues des souches ci-dessus ainsi que le fonctionnement de l'éthériseur (peut être aussi de la loupe bino...)

Je vous tiens au courant bien entendu ;)

 

 

 

 

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